أسباب ظاهرة النينو

يُعزى حدوث ظاهرة النينو إلى مجموعة من العوامل المتداخلة، بحيث يعتقد بعض الباحثين أن تفاعل ما بين المحيط والغلاف الجوي يؤدي إلى تغيرات في حركة الرياح في الجنوب الشرقي للمحيط الهادي. كما تُشير نظريات أخرى إلى اختلال طبقة الأرض المسمّاة بالأديم، ناتج عن كوارث طبيعية كالزلازل والبراكين، ويفترض البعض أن العوامل الخارجية مثل تدفق التيارات الهوائية الباردة أو نشاط البراكين المدارية تلعب دورًا في تفجر النينو. إضافة إلى ذلك، يربط بعض علماء المحيطات التغيرات في الضغط الجوي في القارة القطبية الجنوبية مع ظاهرة النينيو، وحتى نظرية البقع الشمسية أثارت جدلاً حول تأثيرها على حدوث هذه الظاهرة المناخية.